Pliki systemu Filr można zsynchronizować z komputerem, a następnie modyfikować bezpośrednio bez dostępu do witryny Filr. Dodawane i modyfikowane dane są synchronizowane między systemem Filr a komputerem użytkownika.
Aplikacja Filr Desktop jest dostępna dla systemów Windows i Mac. Więcej informacji można znaleźć w następujących podręcznikach: